鲜黄花菜中含有一种“秋水仙碱”的物质，它本身无毒，但经过肠胃道吸收，在体内氧化为“二秋水仙碱”，则具有较大的毒性。
如何正确食用新鲜黄花菜至为重要。
粤语谚语中有一句：“少食多滋味，食多坏肚皮”，用在这里很是恰当。食用鲜黄花菜的量每次不要过多。
鲜黄花菜中的秋水仙碱，易溶于水，食用前可根据这一特性加以处理。如果是花苞，直接清洗干净后浸泡于清水中2-3个小时，期间换一二次水；对已经开放的黄花菜，则要摘干净花蕊，再浸泡于清水中，同样是2-3个小时，期间换一二次水。如果还不放心的话，可入锅汆烫过后再进行制作，食用起来也就妥妥的放心。